RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 DLGAP5Q15398 846 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 UGCGQ16739 394 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.972e-8■■■■■ 72.2
HOXB3-201ENST00000311626 CCDC127Q96BQ5 260 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 FMO2Q99518 471 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 HSPBP1Q9NZL4 362 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CNTNAP1P78357 1384 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 IFFO1Q0D2I5 559 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 STYK1Q6J9G0 422 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SAAL1Q96ER3 474 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 UBE4BO95155 1302 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CYP26A1O43174 497 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 BCRP11274 1271 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 PEX3P56589 373 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 QPCTQ16769 361 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 PLA2G4FQ68DD2 849 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 FAM114A2Q9NRY5 505 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 DHX15O43143 795 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ADRB2P07550 413 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CCDC172P0C7W6 258 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 VCAM1P19320 739 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 IFT88Q13099 833 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 EMC10Q5UCC4 262 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 NSMFQ6X4W1 530 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SLC47A2Q86VL8 602 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 PPM1KQ8N3J5 372 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 OTUD6BQ8N6M0 293 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CAPN7Q9Y6W3 813 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CLSTN1O94985 981 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ALAS1P13196 640 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 COMTP21964 271 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 RARRES1P49788 294 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SOX10P56693 466 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SETQ01105 290 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 JAMLQ86YT9 394 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 FAM151AQ8WW52 585 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SEC14L1Q92503 715 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ERP44Q9BS26 406 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CARD9Q9H257 536 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 TLDC2A0PJX2 215 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 DUPD1Q68J44 220 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SEMA4DQ92854 862 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 A6NNZ2 444 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CAND2O75155 1236 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CHRNB2P17787 502 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CAP2P40123 477 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 TUBB8Q3ZCM7 444 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 CBWD2Q8IUF1 395 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 SLC9A9Q8IVB4 645 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 KCTD17Q8N5Z5 321 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 FBXO25Q8TCJ0 367 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ACCSQ96QU6 501 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF536O15090 1300 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ATP8B3O60423 1300 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 KIAA0754O94854 1291 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 P4HBP07237 508 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 MMEP08473 750 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 EPC2Q52LR7 807 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 TTC27Q6P3X3 843 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 RUFY4Q6ZNE9 571 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 KREMEN1Q96MU8 473 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF341Q9BYN7 854 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 KCND2Q9NZV8 630 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 PPP2R2AP63151 447 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 MTMR3Q13615 1198 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 XXYLT1Q8NBI6 393 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-201ENST00000311626 ANKRD63C9JTQ0 380 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 KCNJ1P48048 391 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 TRAF1Q13077 416 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 TKFCQ3LXA3 575 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 PRELID2Q8N945 189 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 RIT2Q99578 217 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 EPB41L4BQ9H329 900 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB3-201ENST00000311626 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms