RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB18Q99592 522 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 KRT14P02533 472 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ADRA2BP18089 450 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 COPS2P61201 443 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FAM182BQ5T319 152 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 DPF2Q92785 391 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 LXNQ9BS40 222 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 EYA4O95677 639 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 AP3M2P53677 418 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GPS1Q13098 491 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MTF1Q14872 753 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FDX1P10109 184 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ARFIP2P53365 341 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 VSNL1P62760 191 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y3Z8 333 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 CCZ1BP86790 482 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA7Q15375 998 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1NQ8N819 430 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TAP1Q03518 808 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ADSSL1Q8N142 457 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 VPS11Q9H270 941 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 STAT3P40763 770 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ARPP19P56211 112 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SCARF1Q14162 830 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 KIF19Q2TAC6 998 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 HIPK4Q8NE63 616 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 RNF146Q9NTX7 359 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SENP1Q9P0U3 644 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 HUS1O60921 280 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF302Q9NR11 478 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 EMSYQ7Z589 1322 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SRGNP10124 158 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 NFKBIAP25963 317 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TSC22D3Q99576 134 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ASAP2O43150 1006 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GUCY1A2P33402 732 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf60Q5U649 245 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 BEST2Q8NFU1 509 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 BCAR1P56945 870 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 CDR2Q01850 454 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SLC18A3Q16572 532 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD6Q96KE9 485 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM49P0CI25 452 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM49CP0CI26 452 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 BRINP3Q76B58 766 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GPD1LQ8N335 351 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 AGPAT1Q99943 283 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 STAT4Q14765 748 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 POLD4Q9HCU8 107 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SLC1A1P43005 524 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms