RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636010.1

SPTAN1-229, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 1,472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZNF576	Q9H609	170 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	HCST	Q9UBK5	93 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	DENND3	A2RUS2	1198 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	ASAP2	O43150	1006 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	HIP1R	O75146	1068 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	TAP1	Q03518	808 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	GRIN2C	Q14957	1233 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	RAD54L	Q92698	747 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	CPB2	Q96IY4	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PANK2	Q9BZ23	570 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	MSRA	Q9UJ68	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	LINC01553	A4QN01	128 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	RFXAP	O00287	272 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	TSPAN1	O60635	241 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	DGKI	O75912	1065 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	LINC00271	P0C7V0	271 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PHKA2	P46019	1235 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PDILT	Q8N807	584 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	RAD9A	Q99638	391 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	FGFR1	P11362	822 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PEX3	P56589	373 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	CDC42EP1	Q00587	391 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	TFDP1	Q14186	410 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	UBXN11	Q5T124	520 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	GPBP1	Q86WP2	473 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	LPP	Q93052	612 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	YME1L1	Q96TA2	773 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	REEP2	Q9BRK0	252 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPTAN1-229	ENST00000636010	SLC26A4	O43511	780 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	CUTA	O60888	179 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	FOSL2	P15408	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	LIG1	P18858	919 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	GUCY2C	P25092	1073 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	NAMPT	P43490	491 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	NPTX2	P47972	431 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	FAM189B	P81408	668 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	POU5F1B	Q06416	359 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	E2F4	Q16254	413 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	ODR4	Q5SWX8	454 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	MYLIP	Q8WY64	445 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	STAM	Q92783	540 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	KIFAP3	Q92845	792 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	INSL6	Q9Y581	213 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	ERLIN2	O94905	339 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	ME1	P48163	572 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPTAN1-229	ENST00000636010	GIT2	Q14161	759 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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