RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HYI	Q5T013	277 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF217	Q8TC41	542 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	C12orf42	Q96LP6	360 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	COX16	Q9P0S2	106 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CTAGE8	P0CG41	777 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GIT2	Q14161	759 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ILDR2	Q71H61	639 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DPH5	Q9H2P9	285 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TMOD1	P28289	359 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP83	Q9Y592	693 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT86	O43790	486 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	AKAP3	O75969	853 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CD19	P15391	556 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DNM2	P50570	870 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DLG4	P78352	724 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PPAT	Q06203	517 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX1	Q13596	522 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	LGALS16	A8MUM7	142 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	UGCG	Q16739	394 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	VWA3B	Q502W6	1294 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HAUS1	Q96CS2	278 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR64	B1ANS9	1081 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	GJB6	O95452	261 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	OSBP	P22059	807 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF11	P52732	1056 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	OAZ1	P54368	228 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HERVK_113	P62684	666 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	BIRC2	Q13490	618 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MESD	Q14696	234 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF4B	Q92750	862 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	BTBD7	Q9P203	1132 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NR3C1	P04150	777 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	STXBP2	Q15833	593 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	KAZN	Q674X7	775 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	HDX	Q7Z353	690 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	PPM1E	Q8WY54	764 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7

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