RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 PRR16Q569H4 304 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.57■■□□□ 1.52
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CAPNS1-205ENST00000588780 CEP250Q9BV73 2442 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR64B1ANS9 1081 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-205ENST00000588780 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-205ENST00000588780 GPR152Q8TDT2 470 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-205ENST00000588780 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.54■■□□□ 1.52
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CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-205ENST00000588780 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-205ENST00000588780 NRP1O14786 923 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-205ENST00000588780 TEX28O15482 410 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-205ENST00000588780 LILRB3O75022 631 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF623O75123 536 aa24.48■■□□□ 1.51
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