RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SCFD1Q8WVM8 642 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 TUBBP07437 444 aa27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 POTEGQ6S5H5 508 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM59Q8IWR1 403 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35F6Q8N357 371 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.054e-6■□□□□ 9.2
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CAPNS1-204ENST00000587718 NFIL3Q16649 462 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC40Q4G0X9 1142 aa27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF697Q5TEC3 545 aa27.85■■■□□ 2.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM161BQ96MY7 647 aa27.85■■■□□ 2.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 GLIS3Q8NEA6 775 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-204ENST00000587718 REEP2Q9BRK0 252 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MMRN2Q9H8L6 949 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-204ENST00000587718 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MYL3P08590 195 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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