RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DISC1	Q9NRI5	854 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CDH22	Q9UJ99	828 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ALDH2	P05091	517 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GALT	P07902	379 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	WEE2	P0C1S8	567 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	EPCAM	P16422	314 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LETM2	Q2VYF4	491 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PRR16	Q569H4	304 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	XKR3	Q5GH77	459 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZNF410	Q86VK4	478 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FLCN	Q8NFG4	579 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PHKB	Q93100	1093 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	BORCS6	Q96GS4	357 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KCNK12	Q9HB15	430 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	WNT16	Q9UBV4	365 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZNF862	O60290	1169 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GAS7	O60861	476 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	OFD1	O75665	1012 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	C1R	P00736	705 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NPR3	P17342	541 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KLRC2	P26717	231 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ANAPC15	P60006	121 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PRKCE	Q02156	737 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ANGPT1	Q15389	498 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PTPN14	Q15678	1187 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	URGCP	Q8TCY9	931 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LENG9	Q96B70	501 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MSH4	O15457	936 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PI15	O43692	258 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LILRB3	O75022	631 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FGFR4	P22455	802 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CLCN4	P51793	760 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SCRN1	Q12765	414 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	7.68	□□□□□ -1.18	6e-13	■□□□□ 9.5
CS-233	ENST00000552688	ME3	Q16798	604 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GPR65	Q8IYL9	337 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SIX5	Q8N196	739 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CNNM3	Q8NE01	707 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SLC5A5	Q92911	643 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		7.68	□□□□□ -1.18

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