RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.43□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PEX11BO96011 259 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 F2P00734 622 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 SPIDRQ14159 915 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 TKFCQ3LXA3 575 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PCSK4Q6UW60 755 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ARL8AQ96BM9 186 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MNTQ99583 582 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MTFR1LQ9H019 292 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ING3Q9NXR8 418 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.42□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 TGM5O43548 720 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PCDH8O95206 1070 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 CFBP00751 764 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 GAAP10253 952 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 HTR3DQ70Z44 454 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 UIMC1Q96RL1 719 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 LCHNA4D1U4 455 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MTSS1O43312 755 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 CD40P25942 277 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 NEK4P51957 841 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 NPEPPSP55786 919 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MFSD5Q6N075 450 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 EFHBQ8N7U6 833 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 AGAP2Q99490 1192 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 IFT57Q9NWB7 429 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.4□□□□□ -1.38
SSB-211ENST00000490914 MYPNQ86TC9 1320 aa6.4□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 GAS7O60861 476 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CD69Q07108 199 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 TCEA2Q15560 299 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 RABL3Q5HYI8 236 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 KIF18BQ86Y91 864 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.39□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MFAP3LO75121 409 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 FSBPO95073 299 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 HK1P19367 917 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 NR4A1P22736 598 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PTTG1IPP53801 180 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 LRRC32Q14392 662 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MAN2A1Q16706 1144 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MRGPREQ86SM8 312 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ST8SIA2Q92186 375 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 TTPALQ9BTX7 342 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MSRAQ9UJ68 235 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.38□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MAFGO15525 162 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ALDH1A2O94788 518 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 HOMER1Q86YM7 354 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 UBXN4Q92575 508 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 DRC1Q96MC2 740 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 USP18Q9UMW8 372 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.37□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 RAMP2O60895 175 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 LY86O95711 162 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PFKMP08237 780 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 GNAT2P19087 354 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CASRP41180 1078 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms