RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	EFHB	Q8N7U6	833 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC51	Q96ER9	411 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF558	Q96NG5	402 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR9	Q9NR96	1032 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	LTBR	P36941	435 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PTEN	P60484	403 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4A11	Q02928	519 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PDIA5	Q14554	519 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ERMN	Q8TAM6	284 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	NACC1	Q96RE7	527 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDND1	Q9NY35	253 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	SPG21	Q9NZD8	308 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		19.23	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	LAD1	O00515	517 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FSCN2	O14926	492 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2B1	P20020	1258 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB1	P25685	340 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	RPA1	P27694	616 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL2	P36404	184 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	RARRES1	P49788	294 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP4	Q96MN2	994 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	19.22	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	EYA4	O95677	639 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52Z1	P0C646	297 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM7	P33993	719 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	KSR1	Q8IVT5	923 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF149	Q8NC42	400 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM143	Q96AN5	459 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		19.21	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT7A	O00755	349 aa		19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFR4	P22455	802 aa		19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	COASY	Q13057	564 aa		19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB34	Q9BZG1	259 aa		19.2	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB39	O15060	712 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	INPPL1	O15357	1258 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPH	P41219	470 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	GIT2	Q14161	759 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC38	Q5R3I4	469 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	BRAP	Q7Z569	592 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	TLE6	Q9H808	572 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	IRAK3	Q9Y616	596 aa		19.19	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		19.18	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		19.18	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	ERLIN2	O94905	339 aa		19.18	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		19.18	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	19.18	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	IRS1	P35568	1242 aa		19.18	■□□□□ 0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	NOTUM	Q6P988	496 aa		19.18	■□□□□ 0.66

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