RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SCLT1Q96NL6 688 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 TET1Q8NFU7 2136 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 SLC16A4O15374 487 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TRAK2O60296 914 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 CSF2RAP15509 400 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 STRA6Q9BX79 667 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 CCDC169A6NNP5 214 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R37O75864 691 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 AMHR2Q16671 573 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TCTN1Q2MV58 587 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TMEM199Q8N511 208 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 DEPTORQ8TB45 409 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 HPS3Q969F9 1004 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 FZD8Q9H461 694 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 KCNG1Q9UIX4 513 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 EDN1P05305 212 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 CD52P31358 61 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 CASP5P51878 434 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 EFNA5P52803 228 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 FAM187BQ17R55 369 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PADI3Q9ULW8 664 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 RPS6KA5O75582 802 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 RHOBTB3O94955 611 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 FGFR4P22455 802 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 SMTNP53814 917 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 EPHB4P54760 987 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 KCNB1Q14721 858 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TMX1Q9H3N1 280 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 DENND3A2RUS2 1198 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 H0YGN5 161 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 K7ENM7 598 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TSPAN1O60635 241 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PFKMP08237 780 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 SCP2P22307 547 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 GTF2BQ00403 316 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 FPGSQ05932 587 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PAK2Q13177 524 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.115e-27■■■■■ 34.2
ACTB-210ENST00000477812 CAMK4Q16566 473 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 IL23AQ9NPF7 189 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 H0YCG3 227 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 GPR182O15218 404 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 B4GALT5O43286 388 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 MYBP10242 640 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PTMSP20962 102 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 MAPK6Q16659 721 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 GSDMAQ96QA5 445 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-210ENST00000477812 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.96■■□□□ 1.11
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