RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSMD4-208	ENST00000462970	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSMD4-208	ENST00000462970	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PSMD4-208	ENST00000462970	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PSMD4-208	ENST00000462970	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970		C9IYK1	514 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SPTLC2	O15270	562 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	HIP1R	O75146	1068 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CSPG5	O95196	566 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PLA2G4B	P0C869	781 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	FGFR1	P11362	822 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	FOSL2	P15408	326 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	DSC3	Q14574	896 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	USP49	Q70CQ1	688 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	GPBP1	Q86WP2	473 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	ABI1	Q8IZP0	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PPM1E	Q8WY54	764 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	DACT1	Q9NYF0	836 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CTNNB1	P35222	781 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	ME1	P48163	572 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PTEN	P60484	403 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	MCM6	Q14566	821 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	HYI	Q5T013	277 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PDILT	Q8N807	584 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	LPP	Q93052	612 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CHST12	Q9NRB3	414 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	EPOP	A6NHQ4	379 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	B4GALT5	O43286	388 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC26A4	O43511	780 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	TSPAN1	O60635	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	DGKI	O75912	1065 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	YEATS4	O95619	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PRKCB	P05771	671 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	STAT6	P42226	847 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	NAMPT	P43490	491 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PEX3	P56589	373 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	RAD54L	Q92698	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CFAP45	Q9UL16	551 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	MYO7A	Q13402	2215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC16A4	O15374	487 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	HOXA2	O43364	376 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	CUTA	O60888	179 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM13A	O94988	1023 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	NPTXR	O95502	500 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	BRD1	O95696	1058 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SKI	P12755	728 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	RAB27A	P51159	221 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC12A3	P55017	1021 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	ERVK-21	P61565	698 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PSMD4-208	ENST00000462970	EPC2	Q52LR7	807 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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