RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 IGSF21Q96ID5 467 aa29.6■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 SH2D3AQ9BRG2 576 aa29.6■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 TBC1D13Q9NVG8 400 aa29.6■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.59■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF623O75123 536 aa29.59■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 REC8O95072 547 aa29.59■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 PSMC5P62195 406 aa29.59■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 NOMO2Q5JPE7 1267 aa29.59■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 GALNT17Q6IS24 598 aa29.59■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.59■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 GALTP07902 379 aa29.58■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 ANO5Q75V66 913 aa29.58■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 RUFY3Q7L099 469 aa29.58■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 CATSPER4Q7RTX7 472 aa29.58■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 PGBD4Q96DM1 585 aa29.58■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 NLRP4Q96MN2 994 aa29.58■■■□□ 2.33
PBRM1-218ENST00000458294 ST18O60284 1047 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 OFD1O75665 1012 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 ATAT1Q5SQI0 421 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 AUTS2Q8WXX7 1259 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 STK39Q9UEW8 545 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 USTQ9Y2C2 406 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa29.57■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 CPLX1O14810 134 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 BRD1O95696 1058 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 NPY5RQ15761 445 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 LONRF3Q496Y0 759 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PPFIBP1Q86W92 1011 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 KSR1Q8IVT5 923 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 SLC22A17Q8WUG5 538 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa29.56■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 MEIS3P2A8K0S8 358 aa29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 WEE2P0C1S8 567 aa29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 EPCAMP16422 314 aa29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PLA2G4FQ68DD2 849 aa29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PLCD3Q8N3E9 789 aa29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 CYP26B1Q9NR63 512 aa29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 FAM86C1Q9NVL1 165 aa29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 MYO10Q9HD67 2058 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 QARSP47897 775 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 KRT25Q7Z3Z0 450 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 EXOC8Q8IYI6 725 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 URGCPQ8TCY9 931 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 SLC7A3Q8WY07 619 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 IFT122Q9HBG6 1241 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJB4Q9UDY4 337 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PPME1Q9Y570 386 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 DENND4AQ7Z401 1863 aa29.54■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 SLC11A1P49279 550 aa29.53■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PPP2R5CQ13362 524 aa29.53■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 CABP7Q86V35 215 aa29.53■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa29.53■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 EML1O00423 815 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 SLC37A4O43826 429 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 PTPN14Q15678 1187 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 INF2Q27J81 1249 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 FAM20AQ96MK3 541 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 GBP3Q9H0R5 595 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 SFXN1Q9H9B4 322 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 VAV3Q9UKW4 847 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa29.52■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa29.51■■■□□ 2.32
PBRM1-218ENST00000458294 GFRA3O60609 400 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 LETM2Q2VYF4 491 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 KANK3Q6NY19 840 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 AGMOQ6ZNB7 445 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF280BQ86YH2 543 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 AIFM3Q96NN9 605 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 VN1R3Q9BXE9 311 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 KANSL3Q9P2N6 904 aa29.51■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 P4HBP07237 508 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 ASGR2P07307 311 aa29.5■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 NPEPPSP55786 919 aa29.5■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 CEP170P1Q96L14 293 aa29.5■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.5■■■□□ 2.31
PBRM1-218ENST00000458294 RSAD1Q9HA92 442 aa29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms