RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 MBTPS2O43462 519 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 CA8P35219 290 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PLCB3Q01970 1234 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 RNF149Q8NC42 400 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 LZTS1Q9Y250 596 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.82■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ASAP2O43150 1006 aa21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 RAB27AP51159 221 aa21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TMC7Q7Z402 723 aa21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 FERMT3Q86UX7 667 aa21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 POTEMA6NI47 508 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ERLIN2O94905 339 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ZP2Q05996 745 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 C8orf34Q49A92 452 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PGBD4Q96DM1 585 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 MTMR9Q96QG7 549 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 CLEC1BQ9P126 229 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 FSCN2O14926 492 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 BCAR1P56945 870 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 GBP3Q9H0R5 595 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.8■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 A0A087WWV3 80 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 FSD2A1L4K1 749 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 DGAT1O75907 488 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 GLP2RO95838 553 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TFDP1Q14186 410 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF174Q15697 407 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 DUSP6Q16828 381 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM169Q96HH4 297 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.79■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 HIDE1A8MVS5 230 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 LYPLA2O95372 231 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TECP42680 631 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 URGCPQ8TCY9 931 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.78■■□□□ 1.08
NPAS1-201ENST00000439365 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF623O75123 536 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 OFD1O75665 1012 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 EYA4O95677 639 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ALADP13716 330 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 COASYQ13057 564 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.77■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 RARRES1P49788 294 aa21.76■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.76■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ERMNQ8TAM6 284 aa21.76■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.76■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 KIF2CQ99661 725 aa21.76■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 RSAD1Q9HA92 442 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms