RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 NRN1LQ496H8 165 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-208ENST00000427110 ODR4Q5SWX8 454 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 GPR158Q5T848 1215 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-208ENST00000427110 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-208ENST00000427110 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.28□□□□□ -1.88
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