RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 VTNP04004 478 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHKA2P46019 1235 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 STRN3Q13033 797 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTGISQ16647 500 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KSR1Q8IVT5 923 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA5Q8TBA6 731 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP4Q96MN2 994 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBSNQ9H1K0 784 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCTD10Q9H3F6 313 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEMA6BQ9H3T3 888 aa18.63■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ERI5 159 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXD13P35453 343 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPC3P51654 580 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTENP60484 403 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPM4P67936 248 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTK7Q13308 1070 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA1Q5VX52 437 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTI2Q6NXR4 508 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 LUZP1Q86V48 1076 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF214Q8ND24 703 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MED15Q96RN5 788 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 GBP3Q9H0R5 595 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARID2Q68CP9 1835 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK7P50613 346 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 STX17P56962 302 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNA1Q09470 495 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD40Q6AI12 368 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP7Q8WX94 980 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCLT1Q96NL6 688 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOD1Q9Y239 953 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WZ62 844 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FSD2A1L4K1 749 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAND2O75155 1236 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR32O75388 356 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMS1P54277 932 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCAPHQ15003 741 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFIL3Q16649 462 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPK6Q16659 721 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0QZ92 97 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TGFB1I1O43294 461 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL6A1P12109 1028 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIZQ2M2Z5 673 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 UVSSAQ2YD98 709 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM174Q8WUU8 243 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FZD8Q9H461 694 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 B4GALT4O60513 344 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIGRP01833 764 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL13P26373 211 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYBPC2Q14324 1141 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM187BQ17R55 369 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa18.58■□□□□ 0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms