RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.44■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ARL8AQ96BM9 186 aa23.44■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RMDN3Q96TC7 470 aa23.44■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 VPS33BQ9H267 617 aa23.44■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 NCANO14594 1321 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 HSF2BPO75031 334 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ERVK-9P63128 1117 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 NNTQ13423 1086 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 FAM76AQ8TAV0 307 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 THAP2Q9H0W7 228 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM253P0C7T8 217 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TNFAIP3P21580 790 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 MYBPC2Q14324 1141 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TTMPQ5BVD1 217 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 LRRC31Q6UY01 552 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RFFLQ8WZ73 363 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.43■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 KAT5Q92993 513 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 HES6Q96HZ4 224 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 PXMP2Q9NR77 195 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RIPK3Q9Y572 518 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 LYPLA2O95372 231 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 KIF22Q14807 665 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ALS2CLQ60I27 953 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 KRIT1O00522 736 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 GTF2BQ00403 316 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ATG4CQ96DT6 458 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RUFY1Q96T51 708 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 COG5Q9UP83 839 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ADRB2P07550 413 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ALCAMQ13740 583 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 EPC2Q52LR7 807 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 XKR9Q5GH70 373 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 POTEAQ6S8J7 498 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 JDP2Q8WYK2 163 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 AGPAT1Q99943 283 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 AMFRQ9UKV5 643 aa23.41■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 KRT14P02533 472 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 C4orf19Q8IY42 314 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 FZD1Q9UP38 647 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC172P0C7W6 258 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 SOX10P56693 466 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 PSMC5P62195 406 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 PPATQ06203 517 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 PIM2Q9P1W9 311 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.4■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 VWA5AO00534 786 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 OPA1O60313 960 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 RPS6KA5O75582 802 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ECHS1P30084 290 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 SAAL1Q96ER3 474 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.39■■□□□ 1.34
C10orf55-201ENST00000409178 WDR64B1ANS9 1081 aa23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZBED4O75132 1171 aa23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 USP8P40818 1118 aa23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TNFAIP1Q13829 316 aa23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 AMACRQ9UHK6 382 aa23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.39■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF233A6NK53 670 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC169A6NNP5 214 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms