RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 RHOT2Q8IXI1 618 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 THAP2Q9H0W7 228 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 P4HA2O15460 535 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 APBA3O96018 575 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 MDH1P40925 334 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 HADHBP55084 474 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 GUCY1A3Q02108 690 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 TNIP1Q15025 636 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD13-201ENST00000392539 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 HSD17B4P51659 736 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 BIRC3Q13489 604 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DCAF12L1Q5VU92 463 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ACCSQ96QU6 501 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 RAB17Q9H0T7 212 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R14Q9NYV8 317 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 EMSYQ7Z589 1322 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PTENP60484 403 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DLGAP5Q15398 846 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 C12orf56Q8IXR9 622 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 CNTNAP1P78357 1384 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 LRRN2O75325 713 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ITGB5P18084 799 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 VAMP7P51809 220 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF844Q08AG5 666 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PTGISQ16647 500 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 TMC3Q7Z5M5 1100 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 SAMM50Q9Y512 469 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 TBC1D12O60347 775 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 CPP00450 1065 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 CENPHQ9H3R5 247 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PFASO15067 1338 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 RPTORQ8N122 1335 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 FLT3P36888 993 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DLG4P78352 724 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 TCEAL1Q15170 157 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 AGBL2Q5U5Z8 902 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PALB2Q86YC2 1186 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 OR2W6PQ8NHA6 318 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PCIF1Q9H4Z3 704 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 COG5Q9UP83 839 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 EPC2Q52LR7 807 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf63Q6NUN7 778 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DPH5Q9H2P9 285 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 CCPG1Q9ULG6 757 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ICAM1P05362 532 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 SPDYCQ5MJ68 293 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 MAEAQ7L5Y9 396 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 FAM187AA6NFU0 413 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 MAPK13O15264 365 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PLS3P13797 630 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 CAP2P40123 477 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PTGER2P43116 358 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DR1Q01658 176 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PPP3CAQ08209 521 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 NAA35Q5VZE5 725 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGEF19Q8IW93 802 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 XXYLT1Q8NBI6 393 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 SLC20A1Q8WUM9 679 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 NR2E1Q9Y466 385 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 MYO1FO00160 1098 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM51Q9BSJ1 452 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 EFCC1Q9HA90 598 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 HPDP32754 393 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa28.51■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ALG6Q9Y672 507 aa28.51■■■□□ 2.16
HOXD13-201ENST00000392539 ERLIN2O94905 339 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXD13-201ENST00000392539 FTLP02792 175 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
HOXD13-201ENST00000392539 RARRES1P49788 294 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXD13-201ENST00000392539 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXD13-201ENST00000392539 UBL4BQ8N7F7 174 aa28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms