RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390944.1

RNU6-360P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 360, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-360P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-360P-201ENST00000390944 TYRP1P17643 537 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 PTGS1P23219 599 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 TNFSF4P23510 183 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 WASP42768 502 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SLC6A9P48067 706 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 GLRBP48167 497 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 TM4SF4P48230 202 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SARSP49591 514 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 RENBPP51606 427 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CASP5P51878 434 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SLC16A1P53985 500 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 FAM193AP78312 1265 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CD83Q01151 205 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 FMO1Q01740 532 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 MALLQ13021 153 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SNAPC2Q13487 334 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 ACAP1Q15027 740 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CHRNA2Q15822 529 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 MSMPQ1L6U9 139 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 ANO4Q32M45 955 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CCDC157Q569K6 752 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 MUM1L1Q5H9M0 696 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 LVRNQ6Q4G3 990 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 TEPPQ6URK8 271 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 BTNL9Q6UXG8 535 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 TMC5Q6UXY8 1006 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NFXL1Q6ZNB6 911 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 Q6ZVL8 140 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 DAAM2Q86T65 1068 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 RHOT1Q8IXI2 618 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 ANKS4BQ8N8V4 417 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NETO2Q8NC67 525 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 PDZD8Q8NEN9 1154 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 OR14C36Q8NHC7 312 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 PPM1EQ8WY54 764 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SSH1Q8WYL5 1049 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 LRTOMTQ8WZ04 291 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 APIPQ96GX9 242 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CLPTM1LQ96KA5 538 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CRB3Q9BUF7 120 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 AP5M1Q9H0R1 490 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NUP62CLQ9H1M0 184 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 VPS11Q9H270 941 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 MTG2Q9H4K7 406 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 GREM2Q9H772 168 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CASS4Q9NQ75 786 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 INCENPQ9NQS7 918 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 TERF2IPQ9NYB0 399 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 GPRC5BQ9NZH0 403 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 KLHL14Q9P2G3 628 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CPNE7Q9UBL6 633 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 GPR160Q9UJ42 338 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 PCDHA6Q9UN73 950 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 CORO2BQ9UQ03 480 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SLC5A6Q9Y289 635 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 SIK3Q9Y2K2 1263 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 NUB1Q9Y5A7 615 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 TAF6LQ9Y6J9 622 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-360P-201ENST00000390944 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 ZNF839A8K0R7 811 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 NPHP1O15259 732 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 AKR1B10O60218 316 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 OPHN1O60890 802 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 ZBTB7AO95365 584 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 FTLP02792 175 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 AMY1AP04745 511 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 PYGLP06737 847 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 H2AFB1P0C5Y9 115 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 H2AFB2P0C5Z0 115 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 HDCP19113 662 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 CHKAP35790 457 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 PPM1AP35813 382 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 RASSF7Q02833 373 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 ROM1Q03395 351 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 ZNF543Q08ER8 600 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 MGAT5Q09328 741 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-360P-201ENST00000390944 RAPGEF1Q13905 1077 aa2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms