RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377526.3

AUP1-201, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AUP1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-201ENST00000377526 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 SMTNP53814 917 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 PSMD2Q13200 908 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 STRA6Q9BX79 667 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-201ENST00000377526 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 M0QZ92 97 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 GCNT3O95395 438 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 IQCF3P0C7M6 154 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PHKA2P46019 1235 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 MBTPS1Q14703 1052 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 DENND3A2RUS2 1198 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 SELPP16109 830 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 SCN5AQ14524 2016 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 KIAA0355O15063 1070 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 EDN1P05305 212 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 FGFR4P22455 802 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ITGB8P26012 769 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 CYP2C18P33260 490 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 GTF2BQ00403 316 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 KCNN1Q92952 543 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 KCNA1Q09470 495 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 SYCE3A1L190 88 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 GHRP10912 638 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 HOXD13P35453 343 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 EFNA5P52803 228 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 CCL23P55773 120 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 LPIN1Q14693 890 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 GPNMBQ14956 572 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 AMHR2Q16671 573 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 SCLYQ96I15 445 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 FZD8Q9H461 694 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 TBX20Q9UMR3 447 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 USP20Q9Y2K6 914 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 H0YCG3 227 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 K7ERI5 159 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 FAM228AQ86W67 206 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PRKCBP05771 671 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PRCPP42785 496 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 NLRP12P59046 1061 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.47■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 B4GALT5O43286 388 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 NBNO60934 754 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 TIMP1P01033 207 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 ALCAMQ13740 583 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 MAPK6Q16659 721 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 FAM187BQ17R55 369 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms