RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376649.7

PUS1-202, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUS1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-202ENST00000376649 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 PMS2P54278 862 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 DDR1Q08345 913 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 CCDC6Q16204 474 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 STK33Q9BYT3 514 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 ALG6Q9Y672 507 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 RWDD2BP57060 319 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 CDK17Q00537 523 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 CERKQ8TCT0 537 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 BAP1Q92560 729 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.04■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 TISP43B9A030 160 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 ATP5DP30049 168 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 SPP2Q13103 211 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 LRRC15Q8TF66 581 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 BFSP1Q12934 665 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 TMED2Q15363 201 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 WDR91A4D1P6 747 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 MXRA7P84157 204 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 FAM47EQ6ZV65 393 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.03■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 P4HBP07237 508 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 ZNF131P52739 623 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 ASNSP08243 561 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 MARK3P27448 753 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 IGBP1P78318 339 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 RAB20Q9NX57 234 aa16.02■□□□□ 0.16
PUS1-202ENST00000376649 CLDN3O15551 220 aa16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 EPHA7Q15375 998 aa16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ACP6Q9NPH0 428 aa16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 USP20Q9Y2K6 914 aa16.02■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 COMTP21964 271 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 POLD1P28340 1107 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 MAP2K2P36507 400 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 FAM160B2Q86V87 743 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 CCDC89Q8N998 374 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ERVK-9P63128 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 TMEM270Q6UE05 265 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.01■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SGK1O00141 431 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 BSPRYQ5W0U4 402 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ATP6V0A1Q93050 837 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 UNC45AQ9H3U1 944 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 LRRD1A4D1F6 860 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 TLR2O60603 784 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 PRLRP16471 622 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 GNPTABQ3T906 1256 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 AADACL2Q6P093 401 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ACOT2P49753 483 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 CLUL1Q15846 466 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 FLAD1Q8NFF5 587 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ISCUQ9H1K1 167 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 EPN3Q9H201 632 aa16■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ZNF233A6NK53 670 aa15.99■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 K7ERI5 159 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms