RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 PASD1Q8IV76 773 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC26A0AVF1 554 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 SEPT6Q14141 434 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCB1Q15051 598 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 CYFIP1Q7L576 1253 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC197Q8NCU1 140 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF2CQ99661 725 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 EMSYQ7Z589 1322 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 EVI5O60447 810 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC4A1P02730 911 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 MYBL1P10243 752 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 STX1BP61266 288 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC31Q6UY01 552 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFAF2Q8N183 169 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNDC9O14530 226 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A27O95847 323 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 DPEP1P16444 411 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ARID5BQ14865 1188 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 JADE1Q6IE81 842 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD17Q8N5Z5 321 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 M0QYV0 167 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MAFGO15525 162 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM49P0CI25 452 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM49CP0CI26 452 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MMEL1Q495T6 779 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MORC4Q8TE76 937 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS39Q96JC1 886 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PFASO15067 1338 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT7P08729 469 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DBN1Q16643 649 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC10A5Q5PT55 438 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 BAG5Q9UL15 447 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DIP2BQ9P265 1576 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CSPG5O95196 566 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CHGBP05060 677 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6J1Q8NGC5 347 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 UBN1Q9NPG3 1134 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 STXBP3O00186 592 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXN1O15353 648 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKCBP05771 671 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf25Q9BPX7 421 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP61Q8NHU2 1237 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RIT2Q99578 217 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PMLP29590 882 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL4CP56559 192 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ADCY2Q08462 1091 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FAF2Q96CS3 445 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF12Q96FN5 646 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FTLP02792 175 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 IP6K2Q9UHH9 426 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 USH1CQ9Y6N9 552 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MXQ7 604 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX33O43247 280 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO1A2P46721 670 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPN7Q9Y6W3 813 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM205CA6NFA0 338 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEB2O15479 319 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD40Q6AI12 368 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM62Q9BVG3 475 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP85Q9BW27 656 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 JMJD4Q9H9V9 463 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 LMCD1Q9NZU5 365 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT37O76014 449 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DCLK2Q8N568 766 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ACAP3Q96P50 834 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP26B1Q9NR63 512 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms