RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PALB2Q86YC2 1186 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 IFT20Q8IY31 132 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 MICALL2Q8IY33 904 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 SH3GL2Q99962 352 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 HACL1Q9UJ83 578 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR64B1ANS9 1081 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 P4HA2O15460 535 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 RAD51CO43502 376 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT76Q01546 638 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ESYT3A0FGR9 886 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRN2O75325 713 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 FDX1P10109 184 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 SFNP31947 248 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 TNNC1P63316 161 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 GUCY2DQ02846 1103 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PPATQ06203 517 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PEX26Q7Z412 305 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 HES6Q96HZ4 224 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF146Q9NTX7 359 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC16A4O15374 487 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 ADRB2P07550 413 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC172P0C7W6 258 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 NSMFQ6X4W1 530 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-202ENST00000335475 LCTP09848 1927 aa22.52■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP104O60308 925 aa22.51■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 PEX3P56589 373 aa22.51■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 PAK2Q13177 524 aa22.51■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.51■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.51■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 BCS1LQ9Y276 419 aa22.51■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 USP20Q9Y2K6 914 aa22.51■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 PMM2O15305 246 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM153BP0C7A2 387 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 BACE1P56817 501 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM153CQ494X1 144 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 DAAM2Q86T65 1068 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 RDM1Q8NG50 284 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 NFU1Q9UMS0 254 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CLSTN1O94985 981 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 GCLMP48507 274 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 XKR9Q5GH70 373 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ANO5Q75V66 913 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ACTN2P35609 894 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 MREGQ8N565 214 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 GPRASP2Q96D09 838 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CAPN2P17655 700 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFAIP3P21580 790 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ADSSP30520 456 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 TRADDQ15628 312 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 IWS1Q96ST2 819 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 AGPAT1Q99943 283 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms