RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC170Q8IYT3 715 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 TEKT3Q9BXF9 490 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa17.37■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 FRMD3A2A2Y4 597 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 LGALS2P05162 132 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT83P78385 493 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CBX1P83916 185 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK17Q00537 523 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC23Q9UJX2 597 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 VAV3Q9UKW4 847 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 SAMM50Q9Y512 469 aa17.36■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMD10O75832 226 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 GIT2Q14161 759 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC26Q2I0M4 334 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 KAT2BQ92831 832 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP63Q96MT8 703 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 RIT2Q99578 217 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 OGFRQ9NZT2 677 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 KPNA6O60684 536 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC20A2Q08357 652 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 SCFD1Q8WVM8 642 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 C16orf70Q9BSU1 422 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 HAUS4Q9H6D7 363 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 GUCA1BQ9UMX6 200 aa17.35■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CABYRO75952 493 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT76Q01546 638 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 ITGA7Q13683 1181 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF662Q6ZS27 426 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 GLG1Q92896 1179 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 KCTD10Q9H3F6 313 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM10Q9UDY6 481 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 GRIN2DO15399 1336 aa17.34■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BRB1 525 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 BACH1O14867 736 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 GNA14O95837 355 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 MARK3P27448 753 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA0753Q2KHM9 967 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC40Q4G0X9 1142 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM47CQ5HY64 1035 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 PCYT2Q99447 389 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 PLAGL2Q9UPG8 496 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa17.33■□□□□ 0.37
TSNARE1-201ENST00000307180 EML1O00423 815 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 EPHB6O15197 1021 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 PSEN2P49810 448 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD10Q14728 455 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC122Q5T0U0 273 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 ABHD15Q6UXT9 468 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1328Q86T90 577 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 DPF3Q92784 378 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA1Q92805 767 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.33■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 ATG7O95352 703 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 F2P00734 622 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 CLCN6P51797 869 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 CYP4A11Q02928 519 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM60Q495X7 471 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 KCTD17Q8N5Z5 321 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP112Q8N8E3 955 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 RABGGTAQ92696 567 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 REEP2Q9BRK0 252 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 AZI2Q9H6S1 392 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF446Q9NWS9 450 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 RGL1Q9NZL6 768 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.32■□□□□ 0.36
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR64B1ANS9 1081 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms