RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 KLRC3Q07444 240 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 COASYQ13057 564 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PWWP2AQ96N64 755 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 UBN1Q9NPG3 1134 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RIC8AQ9NPQ8 531 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MCM9Q9NXL9 1143 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO3Q9UK99 471 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 FAM187AA6NFU0 413 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GYG2O15488 501 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 FAM200BP0CF97 657 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ACADSP16219 412 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DESP17661 470 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GNAZP19086 355 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GYG1P46976 350 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CPA2P48052 419 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP61Q8NHU2 1237 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C9orf72Q96LT7 481 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 AK8Q96MA6 479 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DCLRE1BQ9H816 532 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NPHS2Q9NP85 383 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM260Q9NX78 707 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SMAPO00193 183 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CLIC2O15247 247 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MGAT5Q09328 741 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C4orf33Q8N1A6 199 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf54Q8WWF1 131 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CKAP2Q8WWK9 683 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 EPB41L4BQ9H329 900 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PASKQ96RG2 1323 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GNAQP50148 359 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 OVGP1Q12889 678 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 UBL4BQ8N7F7 174 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC77Q9BR77 488 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf50Q9HD87 102 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GCNT4Q9P109 453 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PHTF1Q9UMS5 762 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEA13PA6NCF6 341 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ATP5HO75947 161 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MAP7Q14244 749 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf76Q5T2E6 689 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ZDHHC24Q6UX98 284 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ASRGL1Q7L266 308 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC65Q8IXS2 484 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ZFAND2BQ8WV99 257 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DTNBP1Q96EV8 351 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD27Q96NW4 1050 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD63C9JTQ0 380 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DCTN3O75935 186 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GJB6O95452 261 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GJC1P36383 396 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 USP46P62068 366 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GRB10Q13322 594 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MPP2Q14168 576 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PRUNE1Q86TP1 453 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MIPOL1Q8TD10 442 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 BICD1Q96G01 975 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 USP40Q9NVE5 1235 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MYH1P12882 1939 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MYH7P12883 1935 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L3A6NCW0 530 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L4A6NCW7 530 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CA4P22748 312 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINB3P29508 390 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ADCY8P40145 1251 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CETN2P41208 172 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MARCKSL1P49006 195 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PPP2R5EQ16537 467 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DSTYKQ6XUX3 929 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L1Q7RTZ2 530 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 KCNK18Q7Z418 384 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 GPBP1Q86WP2 473 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MEGF6O75095 1541 aa12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms