RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.84e-7■■□□□ 13.8
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SLC39A3-201ENST00000269740 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.28■■□□□ 1.8
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SLC39A3-201ENST00000269740 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa26.28■■□□□ 1.8
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SLC39A3-201ENST00000269740 STRA6Q9BX79 667 aa26.27■■□□□ 1.8
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SLC39A3-201ENST00000269740 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.27■■□□□ 1.8
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SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 KIAA0895Q8NCT3 520 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 FZD8Q9H461 694 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 TIMP1P01033 207 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.24■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM40Q8WWA1 233 aa26.24■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 PPP1R2P41236 205 aa26.22■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 CYP2C18P33260 490 aa26.21■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 TAS1R3Q7RTX0 852 aa26.21■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 MAP4K3Q8IVH8 894 aa26.2■■□□□ 1.79
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SLC39A3-201ENST00000269740 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
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