RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 PARVGQ9HBI0 331 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRH-201ENST00000263434 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SWAP70Q9UH65 585 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC172P0C7W6 258 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 NF2P35240 595 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 BARGINQ6ZT62 677 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 FAM84AQ96KN4 292 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 EYA4O95677 639 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM253P0C7T8 217 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 EMC10Q5UCC4 262 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 TTC27Q6P3X3 843 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 GDAP1Q8TB36 358 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 YY1AP1Q9H869 796 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 TRIM37O94972 964 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 NDUFB10O96000 172 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CREB1P16220 341 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 COMTP21964 271 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 TBK1Q9UHD2 729 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SBF2Q86WG5 1849 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 EMSYQ7Z589 1322 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 DUPD1Q68J44 220 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 68.6
PTPRH-201ENST00000263434 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 GAS7O60861 476 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PPFIA2O75334 1257 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 MAPK7Q13164 816 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 C2CD6Q53TS8 623 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 FAM228AQ86W67 206 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 K7ENM7 598 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SLITRK3O94933 977 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 GH2P01242 217 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 TNIP1Q15025 636 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PRELID2Q8N945 189 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SGSM3Q96HU1 749 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PWWP2AQ96N64 755 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 AGPAT1Q99943 283 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 VAV3Q9UKW4 847 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PYGMP11217 842 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PPATQ06203 517 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 WDR18Q9BV38 432 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 GPR88Q9GZN0 384 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM150BA6NC51 233 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC169A6NNP5 214 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 GJC1P36383 396 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CRKP46108 304 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 EPC2Q52LR7 807 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SGPL1O95470 568 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CYP3A7P24462 503 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 JAG1P78504 1218 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 AP3B2Q13367 1082 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRH-201ENST00000263434 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms