RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 TXLNAP40222 546 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 ME1P48163 572 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 POU5F1BQ06416 359 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 ARSHQ5FYA8 562 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 RGS18Q9NS28 235 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.3■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 DENND3A2RUS2 1198 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 ARHGEF15O94989 841 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 GUCY2CP25092 1073 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 GPBP1Q86WP2 473 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 KIFAP3Q92845 792 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 PANK2Q9BZ23 570 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.29■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 LCHNA4D1U4 455 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 C9IYK1 514 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 TLL1O43897 1013 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 PDILTQ8N807 584 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 SPATA32Q96LK8 384 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 CERS4Q9HA82 394 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 THEGQ9P2T0 379 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 STK17AQ9UEE5 414 aa23.28■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 NAMPTP43490 491 aa23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 AMHR2Q16671 573 aa23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 KCND2Q9NZV8 630 aa23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
COX5B-201ENST00000258424 SFI1A8K8P3 1242 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 RFXAPO00287 272 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TSPAN1O60635 241 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TAP1Q03518 808 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 PPP2R5AQ15172 486 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 IFT74Q96LB3 600 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 DRC1Q96MC2 740 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 RAD9AQ99638 391 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 REEP2Q9BRK0 252 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TIPINQ9BVW5 301 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.26■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 STAT6P42226 847 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 PEX3P56589 373 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 E2F4Q16254 413 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 RESP18Q5W5W9 173 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 SPRED2Q7Z698 418 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 DEPTORQ8TB45 409 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ASB2Q96Q27 587 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 CHST12Q9NRB3 414 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.25■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 B4GALT5O43286 388 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ERLIN2O94905 339 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 EDN1P05305 212 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 NPTX2P47972 431 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 GATMP50440 423 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 FAM189BP81408 668 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 GIT2Q14161 759 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms