RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 C4orf19Q8IY42 314 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 PLVAPQ9BX97 442 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TNNI1P19237 187 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 CETN2P41208 172 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 MIIPQ5JXC2 388 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 HDXQ7Z353 690 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF302Q9NR11 478 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 KRT5P13647 590 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ANXA13P27216 316 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 MFAP3P55082 362 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 XKR3Q5GH77 459 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 LENG9Q96B70 501 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 FAM81BQ96LP2 452 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 CEP83Q9Y592 693 aa11.51□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 DENND3A2RUS2 1198 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GFPT2O94808 682 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 MOCS3O95396 460 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 VAMP7P51809 220 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 MEA1Q16626 185 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ARSHQ5FYA8 562 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 PEX26Q7Z412 305 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 FAM167AQ96KS9 214 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TRPC6Q9Y210 931 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 EDIL3O43854 480 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TADA3O75528 432 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 UCHL3P15374 230 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 HVCN1Q96D96 273 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 NT5C1BQ96P26 610 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ITGB5P18084 799 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GHRHRQ02643 423 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 MYBPC2Q14324 1141 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD7Q92527 254 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 PSMB7Q99436 277 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 RNF14Q9UBS8 474 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 MYPNQ86TC9 1320 aa11.5□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 SLC25A27O95847 323 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 FMO5P49326 533 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 C8orf74Q6P047 294 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ERO1BQ86YB8 467 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 BFSP1Q12934 665 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 KLRG1Q96E93 195 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ATP8B1O43520 1251 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 RARRES1P49788 294 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 SLC18A3Q16572 532 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF233A6NK53 670 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 K7ERI5 159 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 AKAP3O75969 853 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 DNERQ8NFT8 737 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC15Q8TF66 581 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.49□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.48□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC151A5D8V7 595 aa11.48□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.48□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.48□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.48□□□□□ -0.57
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM49P0CI25 452 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms