RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	GAS7	O60861	476 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EHHADH	Q08426	723 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SPA17	Q15506	151 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GPBP1	Q86WP2	473 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HPS3	Q969F9	1004 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	VPS16	Q9H269	839 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	THAP9	Q9H5L6	903 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RNF146	Q9NTX7	359 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RLF	Q13129	1914 aa		16.64	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF233	A6NK53	670 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC3	O43617	180 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	BCR	P11274	1271 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CYP11B2	P19099	503 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SCTR	P47872	440 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	DNM2	P50570	870 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SLC12A3	P55017	1021 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FAM210A	Q96ND0	272 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PANK4	Q9NVE7	773 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CSAD	Q9Y600	493 aa		16.63	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP73	A6NFT4	308 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF185	O15231	689 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	KRT14	P02533	472 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZBED6	P86452	979 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	COASY	Q13057	564 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FIGN	Q5HY92	759 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	IL31RA	Q8NI17	732 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RIPK3	Q9Y572	518 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MYPN	Q86TC9	1320 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PQJ5	194 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ATP6V1G2	O95670	118 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ITGB5	P18084	799 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PSMC6	P62333	389 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CENPP	Q6IPU0	288 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	WDR59	Q6PJI9	974 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NSMF	Q6X4W1	530 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TATDN2	Q93075	761 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RIT2	Q99578	217 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		16.62	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ATP2A1	O14983	1001 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CHMP2A	O43633	222 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EPHX2	P34913	555 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CYP4A11	Q02928	519 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ARSH	Q5FYA8	562 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD16	Q68DU8	428 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SPAG5	Q96R06	1193 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RGL1	Q9NZL6	768 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	WDR90	Q96KV7	1748 aa		16.61	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EYA4	O95677	639 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MUT	P22033	750 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25

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