RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM151AQ8WW52 585 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRGUKQ96M69 825 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 MENTQ9BUN1 341 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 SARGQ9BW04 601 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GP6Q9HCN6 339 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM50BQ9Y247 325 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CENPFP49454 3210 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 FKTNO75072 461 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 FKBP9O95302 570 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 MCAMP43121 646 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GTF2A2P52657 109 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GUCY1A3Q02108 690 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPP2R5DQ14738 602 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCL15Q16663 113 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 AACSQ86V21 672 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ERO1BQ86YB8 467 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 HTTP42858 3142 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 EYSQ5T1H1 3165 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDC14CA4D256 554 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 HMMRO75330 724 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 FGAP02671 866 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CETPP11597 493 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 HOXC12P31275 282 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAP4K2Q12851 820 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q7L0L9 218 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 VTA1Q9NP79 307 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPR108Q9NPR9 543 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 AQP7O14520 342 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 AXIN1O15169 862 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 SHOXO15266 292 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GAS7O60861 476 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ENTPD3O75355 529 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 BAG3O95817 575 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DLGAP3O95886 979 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADH6P28332 368 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAP3K12Q12852 859 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRHR2Q13324 411 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNAPC2Q13487 334 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF18BQ86Y91 864 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 TEX11Q8IYF3 940 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CPA6Q8N4T0 437 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DEFB123Q8N688 67 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms