RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 KSR1Q8IVT5 923 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 ABI1Q8IZP0 508 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 RNF169Q8NCN4 708 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 MED24O75448 989 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 ERLIN2O94905 339 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 MUTP22033 750 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 PRPHP41219 470 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 GPM6BQ13491 265 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 PDIA5Q14554 519 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 DSC3Q14574 896 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 POTEGQ6S5H5 508 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 BRAPQ7Z569 592 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 FERMT3Q86UX7 667 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 RNF149Q8NC42 400 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 CHST12Q9NRB3 414 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 A0A0C4DFX4 3053 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 H3BNC9 293 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 LPXNO60711 386 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 RB1P06400 928 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 SKIP12755 728 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 BMPR1AP36894 532 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 KRT79Q5XKE5 535 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 AAASQ9NRG9 546 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 THEGQ9P2T0 379 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 A0A087WWV3 80 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 GATMP50440 423 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 FAM189BP81408 668 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 HSCBQ8IWL3 235 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 PLVAPQ9BX97 442 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 A0A0U1RQF3 1178 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 EOMESO95936 686 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 BMP15O95972 392 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 FGFR1P11362 822 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 RAB27AP51159 221 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 PADI6Q6TGC4 694 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.87□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 REV3LO60673 3130 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 LRRC43Q8N309 656 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 P2RX5Q93086 422 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 DNM3Q9UQ16 869 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 LAG3P18627 525 aa14.85□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 GLRA2P23416 452 aa14.85□□□□□ -0.03
SENP3-209ENST00000610454 ARL2P36404 184 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms