RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589501.1

TYMSP2-201, Transcript of thymidylate synthetase pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene TYMSP2, Length 424 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP2-201ENST00000589501 UBE3AQ05086 875 aa14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 DRP2Q13474 957 aa14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 MTMR9Q96QG7 549 aa14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 FAM50BQ9Y247 325 aa14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 A0A0U1RQF3 1178 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 LAD1O00515 517 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ERLIN2O94905 339 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 SLITRK3O94933 977 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 MUTP22033 750 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PPM1AP35813 382 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.94□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 POTEMA6NI47 508 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 H3BQV1 296 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 LINC00271P0C7V0 271 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 FERMT3Q86UX7 667 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 RNF169Q8NCN4 708 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PGBD4Q96DM1 585 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TMX3Q96JJ7 454 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.93□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 GRM6O15303 877 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 FGFR1P11362 822 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 AXLP30530 894 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TECP42680 631 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 RARRES1P49788 294 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TFF2Q03403 129 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 POU5F1BQ06416 359 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ZNF174Q15697 407 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 RNF149Q8NC42 400 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TMEM143Q96AN5 459 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 NACC1Q96RE7 527 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.92□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TNFRSF10AO00220 468 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ITGB1P05556 798 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 FGFR4P22455 802 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 RPA1P27694 616 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 GATMP50440 423 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 KRT17Q04695 432 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 MCTP1Q6DN14 999 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 HACE1Q8IYU2 909 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 CNNM3Q8NE01 707 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 POF1BQ8WVV4 589 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 CCDC51Q96ER9 411 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ZNF558Q96NG5 402 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 LZTS1Q9Y250 596 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 EYSQ5T1H1 3165 aa14.91□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 WNT7AO00755 349 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 KCNA5P22460 613 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 NOTUMQ6P988 496 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 KSR1Q8IVT5 923 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 URGCPQ8TCY9 931 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms