RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 ADAMTS3O15072 1205 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CHMP2AO43633 222 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 GAS7O60861 476 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SKIP12755 728 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 USP11P51784 963 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 GIT2Q14161 759 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 VPS52Q8N1B4 723 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CACNA1HO95180 2353 aa21.89■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 MSH4O15457 936 aa21.88■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 Q6ZUG5 572 aa21.88■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 LENG9Q96B70 501 aa21.88■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CDH22Q9UJ99 828 aa21.88■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 BRD1O95696 1058 aa21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 BRF1Q92994 677 aa21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.87■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 WDR81Q562E7 1941 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.094e-8■■□□□ 14.2
FOXN3-211ENST00000555855 PHKA2P46019 1235 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 MTERF2Q49AM1 385 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 XKR3Q5GH77 459 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 RDM1Q8NG50 284 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SLC5A5Q92911 643 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PHKBQ93100 1093 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SNX27Q96L92 541 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 IRAK3Q9Y616 596 aa21.86■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 WEE2P0C1S8 567 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 UGCGQ16739 394 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 IGSF21Q96ID5 467 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ZBP1Q9H171 429 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 USTQ9Y2C2 406 aa21.85■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 A0A087WZ62 844 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CTSAP10619 480 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CPA1P15085 419 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 NLRP5P59047 1200 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CABP7Q86V35 215 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CDC45O75419 566 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ASGR2P07307 311 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 GALTP07902 379 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 DRP2Q13474 957 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 LONRF3Q496Y0 759 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF410Q86VK4 478 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 LPPQ93052 612 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PGBD4Q96DM1 585 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 STK39Q9UEW8 545 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.83■■□□□ 1.09
FOXN3-211ENST00000555855 PROB1E7EW31 1015 aa21.82■■□□□ 1.08
FOXN3-211ENST00000555855 PSMD10O75832 226 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms