RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 KANK1Q14678 1352 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 USP32Q8NFA0 1604 aa6.94□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 RREB1Q92766 1687 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PXDNQ92626 1479 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 RFPL3O75679 317 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 HSPA6P17066 643 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 MC4RP32245 332 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PPP2CBP62714 309 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PPP2CAP67775 309 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SURF1Q15526 300 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 TM4SF20Q53R12 229 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 HOMER1Q86YM7 354 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 AJUBAQ96IF1 538 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 GBP4Q96PP9 640 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 KIF15Q9NS87 1388 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CEP162Q5TB80 1403 aa6.93□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 K7ESM1 405 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 FOXP2O15409 715 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 HIP1RO75146 1068 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 KRT37O76014 449 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 FLT3P36888 993 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PRELPP51888 382 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 IRF9Q00978 393 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF460Q14592 562 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 TCEA2Q15560 299 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 WDR48Q8TAF3 677 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ASB15Q8WXK1 588 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SYT17Q9BSW7 474 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 JADE2Q9NQC1 790 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 METP08581 1390 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ADGRL2O95490 1459 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 LAMTOR5O43504 91 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 MPIG6BO95866 241 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 POLD1P28340 1107 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ECE1P42892 770 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 HIPK4Q8NE63 616 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 APPBP2Q92624 585 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 WNK4Q96J92 1243 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 BOCQ9BWV1 1114 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 BTBD2Q9BX70 525 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 AMNQ9BXJ7 453 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 KATNBL1Q9H079 304 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 FANCLQ9NW38 375 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 FAM83GA6ND36 823 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 RASSF10A6NK89 507 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 TRAF5O00463 557 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 JMJD7P0C870 316 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 SDHAP31040 664 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CSF2RBP32927 897 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 IL13RA1P78552 427 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 GPR162Q16538 588 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CFAP100Q494V2 611 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CABP5Q9NP86 173 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ASB1Q9Y576 335 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.9□□□□□ -1.3
ATXN3-218ENST00000553309 ERBINQ96RT1 1412 aa6.9□□□□□ -1.31
ATXN3-218ENST00000553309 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 307.7 ms