RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TPH2	Q8IWU9	490 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TCP11	Q8WWU5	503 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	SCLT1	Q96NL6	688 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CASD1	Q96PB1	797 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	AAAS	Q9NRG9	546 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ZBTB39	O15060	712 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	SKI	P12755	728 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	MUT	P22033	750 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	KCNQ1	P51787	676 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	GUCY1B3	Q02153	619 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CYP4A11	Q02928	519 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	EMC2	Q15006	297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	XKR9	Q5GH70	373 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	FERMT3	Q86UX7	667 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CWH43	Q9H720	699 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	KIF3A	Q9Y496	699 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TNFRSF10A	O00220	468 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	DGAT1	O75907	488 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	FGFR1	P11362	822 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	MCM7	P33993	719 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PHKA2	P46019	1235 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	MCM2	P49736	904 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	RARRES1	P49788	294 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	RAB27A	P51159	221 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	FOSB	P53539	338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	KSR1	Q8IVT5	923 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TMX3	Q96JJ7	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LZTS1	Q9Y250	596 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	POTEM	A6NI47	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LAG3	P18627	525 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	FGFR4	P22455	802 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	DNAJB1	P25685	340 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	RPA1	P27694	616 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ARL2	P36404	184 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PTEN	P60484	403 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PDIA5	Q14554	519 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TMEM143	Q96AN5	459 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	NLRP4	Q96MN2	994 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	MTR	Q99707	1265 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ARID2	Q68CP9	1835 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LAD1	O00515	517 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	FGF18	O76093	207 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ATP2B1	P20020	1258 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	KCNA5	P22460	613 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PPM1A	P35813	382 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LTBR	P36941	435 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36

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