RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 GCNT4Q9P109 453 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TBX20Q9UMR3 447 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ASB14A6NK59 587 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CCP110O43303 1012 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ATG7O95352 703 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 KCNJ6P48051 423 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 METTL13Q8N6R0 699 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 SCFD2Q8WU76 684 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.21□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 SPAG5Q96R06 1193 aa9.21□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 AKR1B10O60218 316 aa9.2□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 NOL4O94818 638 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GJB1P08034 283 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CBWD6Q4V339 395 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 STRA6Q9BX79 667 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 SCN4AP35499 1836 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 WDR90Q96KV7 1748 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 KRT13P13646 458 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 PON1P27169 355 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ADSSP30520 456 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GCLMP48507 274 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.2□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 DEPTORQ8TB45 409 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.2□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.2□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 STRNO43815 780 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ZNF286BP0CG31 522 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 UCHL3P15374 230 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 NCKAP1LP55160 1127 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 BFSP1Q12934 665 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GBP6Q6ZN66 633 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 AFG1LQ8WV93 481 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 BAP1Q92560 729 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 MAF1Q9H063 256 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 UNCXA6NJT0 531 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 K7ERI5 159 aa9.19□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 CLSTN1O94985 981 aa9.19□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 LIG4P49917 911 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 SEZ6Q53EL9 994 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 FIGNQ5HY92 759 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 ZIC5Q96T25 663 aa9.19□□□□□ -0.94
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