RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524784.1

PACS1-202, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 540 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-202ENST00000524784 HVCN1Q96D96 273 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 ACCSQ96QU6 501 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 SETD4Q9NVD3 440 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 CABYRO75952 493 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 GLRA2P23416 452 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 NCKAP1LP55160 1127 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 GTF2BQ00403 316 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 SPAG1Q07617 926 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 STRN3Q13033 797 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 KCNA10Q16322 511 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 TTI2Q6NXR4 508 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 BSNDQ8WZ55 320 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 MED15Q96RN5 788 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 FIZ1Q96SL8 496 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 MAP7D2Q96T17 732 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-202ENST00000524784 WDR81Q562E7 1941 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 DENND3A2RUS2 1198 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 K7ERI5 159 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 PDXKO00764 312 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 PPP1R37O75864 691 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 SERPINC1P01008 464 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 ASGR1P07306 291 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 CDC42EP1Q00587 391 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 STRA6Q9BX79 667 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 TRIM5Q9C035 493 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 GBP3Q9H0R5 595 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 THAP9Q9H5L6 903 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 TBX20Q9UMR3 447 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 AKT3Q9Y243 479 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 CETN3O15182 167 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 TPM2P07951 284 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 CYP2C9P11712 490 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 CLCN3P51790 818 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 EFNA5P52803 228 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 LBX1P52954 281 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 ADAM9Q13443 819 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 DRP2Q13474 957 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 LHX8Q68G74 356 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 KSR1Q8IVT5 923 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 RNF149Q8NC42 400 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 NLRP4Q96MN2 994 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 CEP63Q96MT8 703 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 RNF208Q9H0X6 261 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.62□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PACS1-202ENST00000524784 KCNJ18B7U540 433 aa11.62□□□□□ -0.55
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