RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500025.2

CSTF3-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSTF3-AS1, Length 2,031 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 WNT10BO00744 389 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 EYA4O95677 639 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CALML4Q96GE6 196 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TMX2Q9Y320 296 aa9.67□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KCNJ18B7U540 433 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MMP14P50281 582 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KCNJ12Q14500 433 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TTI2Q6NXR4 508 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TBC1D5Q92609 795 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 VPS16Q9H269 839 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PPT2Q9UMR5 302 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CYP3A7P24462 503 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CAP2P40123 477 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 DGKGP49619 791 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 USP11P51784 963 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZBED6P86452 979 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PTPN14Q15678 1187 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KRT79Q5XKE5 535 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SV2BQ7L1I2 683 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 DYMQ7RTS9 669 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RAD54LQ92698 747 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MBOAT7Q96N66 472 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CENPOQ9BU64 300 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 EXOC1Q9NV70 894 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 UBP1Q9NZI7 540 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.66□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 A6NHS1 94 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 N4BP3O15049 544 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TNFAIP3P21580 790 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KCNJ6P48051 423 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 STAT2P52630 851 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ITKQ08881 620 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 USP4Q13107 963 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FAM83AQ86UY5 434 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LENG9Q96B70 501 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SCLT1Q96NL6 688 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 STK17AQ9UEE5 414 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.65□□□□□ -0.86
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 A0A1W2PRQ8 180 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FAM86B1E9PN63 330 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PSMA7O14818 248 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 AP3B2Q13367 1082 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MTF1Q14872 753 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PRR16Q569H4 304 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KIFC2Q96AC6 838 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.65□□□□□ -0.87
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms