RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-208ENST00000493607 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.751e-7■■■□□ 17.8
SERBP1-208ENST00000493607 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.01■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.01■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 MTRQ99707 1265 aa26.01■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.01■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 POTEMA6NI47 508 aa26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ATP2B1P20020 1258 aa26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 RARRES1P49788 294 aa26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 FERMT3Q86UX7 667 aa26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 AAASQ9NRG9 546 aa26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 XIRP2A4UGR9 3374 aa26■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 LAD1O00515 517 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ZBTB39O15060 712 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 SKIP12755 728 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 RPA1P27694 616 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.754e-7■■□□□ 11.9
SERBP1-208ENST00000493607 COL19A1Q14993 1142 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF174Q15697 407 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ERMNQ8TAM6 284 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 NLRP4Q96MN2 994 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 TTC28Q96AY4 2481 aa25.99■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 GRM6O15303 877 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 GATMP50440 423 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 KSR1Q8IVT5 923 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 TMEM143Q96AN5 459 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 RNF19AQ9NV58 838 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 STK24Q9Y6E0 443 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 MYO7AQ13402 2215 aa25.98■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 NCOR1O75376 2440 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 TBKBP1A7MCY6 615 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 NCK2O43639 380 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF623O75123 536 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 FGFR4P22455 802 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 TECP42680 631 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 RAB27AP51159 221 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 UBE3AQ05086 875 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PDIA5Q14554 519 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 NACC1Q96RE7 527 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa25.97■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 BMP1P13497 986 aa25.96■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 PHKA2P46019 1235 aa25.96■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.96■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.96■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.96■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 CASD1Q96PB1 797 aa25.96■■□□□ 1.75
SERBP1-208ENST00000493607 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 ITGB1P05556 798 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 FGFR1P11362 822 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 LAG3P18627 525 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 GJB2P29033 226 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 ARL2P36404 184 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 PRPHP41219 470 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 ABI1Q8IZP0 508 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 LRRC43Q8N309 656 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 KLHL23Q8NBE8 558 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 BACH2Q9BYV9 841 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 RAB34Q9BZG1 259 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 CWH43Q9H720 699 aa25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 MED24O75448 989 aa25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 PTENP60484 403 aa25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 TFF2Q03403 129 aa25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 CAMK1Q14012 370 aa25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 TFDP1Q14186 410 aa25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 RNF149Q8NC42 400 aa25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 CARNS1A5YM72 827 aa25.93■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.93■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 AXLP30530 894 aa25.93■■□□□ 1.74
SERBP1-208ENST00000493607 PTGDRQ13258 359 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms