RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484840.5

GTF2I-209, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 4

Gene GTF2I, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-209ENST00000484840 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 NSMFQ6X4W1 530 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 TMC6Q7Z403 805 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 LDHDQ86WU2 507 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 CNBD1Q8NA66 436 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 GPR27Q9NS67 375 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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GTF2I-209ENST00000484840 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 X6R8D5 127 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 N4BP3O15049 544 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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GTF2I-209ENST00000484840 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 KRTAP10-2P60368 255 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 ST5P78524 1137 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 DDR1Q08345 913 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 CABP7Q86V35 215 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 JMYQ8N9B5 988 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 MZB1Q8WU39 189 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 UBXN4Q92575 508 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.65□□□□□ -1.34
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GTF2I-209ENST00000484840 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2I-209ENST00000484840 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 ABCC12Q96J65 1359 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 C22orf46C9J442 243 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 MYO1BO43795 1136 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 NTSR2O95665 410 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 NTRK1P04629 796 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 FAM153BP0C7A2 387 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 BCL6P41182 706 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 EPHB3P54753 998 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 ATP8B2P98198 1209 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 CEP68Q76N32 757 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.64□□□□□ -1.35
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GTF2I-209ENST00000484840 DCAF4Q8WV16 495 aa6.64□□□□□ -1.35
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GTF2I-209ENST00000484840 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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GTF2I-209ENST00000484840 NYXQ9GZU5 481 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 GREM2Q9H772 168 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.64□□□□□ -1.35
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GTF2I-209ENST00000484840 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 H7BY64 318 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 PDE8AO60658 829 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 MSCO60682 206 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 POLD1P28340 1107 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 FOXO4P98177 505 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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GTF2I-209ENST00000484840 LSAMPQ13449 338 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 SLC9A5Q14940 896 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 KCNA10Q16322 511 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 MROH9Q5TGP6 573 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 USP53Q70EK8 1073 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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GTF2I-209ENST00000484840 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 9.5
GTF2I-209ENST00000484840 KAZALD1Q96I82 304 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 DNAJC7Q99615 494 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF2I-209ENST00000484840 SPEF2Q9C093 1822 aa6.62□□□□□ -1.35
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