RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1-209ENST00000469140 GRK4P32298 578 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ZNF75DP51815 510 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MFSD10Q14728 455 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 GRIK4Q16099 956 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 GNASQ5JWF2 1037 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.94■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 KLRC1P26715 233 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PSEN2P49810 448 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 IGBP1P78318 339 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CEP63Q96MT8 703 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 GBP3Q9H0R5 595 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 NRCAMQ92823 1304 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 KCNJ18B7U540 433 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 TGFB1I1O43294 461 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CBFA2T2O43439 604 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PGK1P00558 417 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 INHAP05111 366 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 KCNJ12Q14500 433 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 IFNKQ9P0W0 207 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.93■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 DENND3A2RUS2 1198 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MYADML2A6NDP7 307 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ASAP2O43150 1006 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MSCO60682 206 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ADAMTS4O75173 837 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 UBASH3AP57075 661 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 DRP2Q13474 957 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 NFIL3Q16649 462 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MTHFD1LQ6UB35 978 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 KSR1Q8IVT5 923 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 METTL13Q8N6R0 699 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 TBX20Q9UMR3 447 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.92■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 TMOD1P28289 359 aa25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 DEPTORQ8TB45 409 aa25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.91■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CETN3O15182 167 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ADAM9Q13443 819 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 LINC01465Q8N7H1 131 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 GNA14O95837 355 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 TPM3P06753 285 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 NR2F2P24468 414 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CAPSQ13938 189 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 SETD4Q9NVD3 440 aa25.9■■□□□ 1.74
MTA1-209ENST00000469140 CDC25BP30305 580 aa25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 CLCN3P51790 818 aa25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 TFDP1Q14186 410 aa25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 KRT31Q15323 416 aa25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.89■■□□□ 1.73
MTA1-209ENST00000469140 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 194.8 ms