RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL4Q9C0H6 718 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ENC1O14682 589 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K6O95382 1288 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DRAP01903 254 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NPTX2P47972 431 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 LPIN1Q14693 890 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 JADE1Q6IE81 842 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SSH3Q8TE77 659 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ITPKCQ96DU7 683 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SCYL1Q96KG9 808 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SBNO1A3KN83 1393 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MAP2K7O14733 419 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TIPRLO75663 272 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KRT15P19012 456 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NFYCQ13952 458 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EFR3AQ14156 821 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SQLEQ14534 574 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BORCS5Q969J3 196 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 COG3Q96JB2 828 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TTC25Q96NG3 672 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CLIC6Q96NY7 704 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM15Q9C019 465 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CYLDQ9NQC7 956 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 STOML2Q9UJZ1 356 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF37A1IGU5 675 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CENPXA8MT69 81 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 OPLAHO14841 1288 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA3EO15041 775 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RGS5O15539 181 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZBED4O75132 1171 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF12P17014 697 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GDI2P50395 445 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HDGFP51858 240 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PDE4DQ08499 809 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 LIN52Q52LA3 116 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 STK32AQ8WU08 396 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TNIP3Q96KP6 325 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RILPQ96NA2 401 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 VPS35Q96QK1 796 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NUP85Q9BW27 656 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 STK33Q9BYT3 514 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EHD1Q9H4M9 534 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EPB41L5Q9HCM4 733 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MYPNQ86TC9 1320 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PHF20L1A8MW92 1017 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 A8MXQ7 604 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FBP2O00757 339 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM127O75204 238 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF15O94989 841 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CTNNA2P26232 953 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GSSP48637 474 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NIPAL4Q0D2K0 466 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HACE1Q8IYU2 909 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TEX19Q8NA77 164 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FAM161BQ96MY7 647 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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