RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 SKOR1P84550 965 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 GHRHRQ02643 423 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF22Q14807 665 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 SRLQ86TD4 932 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 GOLPH3Q9H4A6 298 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 K7ENM7 598 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 P4HA2O15460 535 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM49P0CI25 452 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM49CP0CI26 452 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP3K10Q02779 954 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TTMPQ5BVD1 217 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAAF5Q86Y56 855 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFAIP3P21580 790 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 IRAK1P51617 712 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 CETN1Q12798 172 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ARL8AQ96BM9 186 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ACCSQ96QU6 501 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 MYH11P35749 1972 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 KRIT1O00522 736 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 LYPLA2O95372 231 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 GUCY2FP51841 1108 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TIPINQ9BVW5 301 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 VPS33BQ9H267 617 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ERVK-9P63128 1117 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TTLL6Q8N841 843 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC26Q8TAB7 109 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF536O15090 1300 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 MAPK13O15264 365 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PPATQ06203 517 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 LMO3Q8TAP4 145 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PLS3P13797 630 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 CLUL1Q15846 466 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 MAATS1Q7Z4T9 603 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC45Q96CN5 670 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 HOOK2Q96ED9 719 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD62A6NC57 917 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF233A6NK53 670 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 INPP5BP32019 993 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TKFCQ3LXA3 575 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 VAMP7P51809 220 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP2R5EQ16537 467 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 EMC10Q5UCC4 262 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 IWS1Q96ST2 819 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 AGPAT1Q99943 283 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 COL20A1Q9P218 1284 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 MYO1CO00159 1063 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 RARRES1P49788 294 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 HADHBP55084 474 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 LPAR1Q92633 364 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms