RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390924.1

RNU6-907P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 907, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-907P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-907P-201ENST00000390924 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 KCTD13Q8WZ19 329 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 GINM1Q9NU53 330 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 DENND2AQ9ULE3 1009 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 GAGE12BA1L429 117 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 TOX4O94842 621 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 SOD2P04179 222 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 SNHG28P0DPA3 235 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 BMPR1AP36894 532 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 RARRES1P49788 294 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 CACNA2D1P54289 1103 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 KRTAP10-5P60370 271 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 PIK3R6Q5UE93 754 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 EPC1Q9H2F5 836 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 KLK15Q9H2R5 256 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 RNF181Q9P0P0 153 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 TP73O15350 636 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 STC2O76061 302 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 VSIG10L2P0DP72 767 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 ITGAMP11215 1152 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 CASP7P55210 303 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 HERVK_113P62684 666 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 TP53BP2Q13625 1128 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 DDB1Q16531 1140 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 ASB10Q8WXI3 467 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 NDC1Q9BTX1 674 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 MGST3O14880 152 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 KCNA1Q09470 495 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 MAP4K2Q12851 820 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 SPIDRQ14159 915 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 MTX3Q5HYI7 312 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 HAPLN2Q9GZV7 340 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 IPPKQ9H8X2 491 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 DKK2Q9UBU2 259 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 JUNP05412 331 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 HLA-DOAP06340 250 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 ZNF76P36508 570 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 PROK1P58294 105 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 KCNT2Q6UVM3 1135 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 CALML6Q8TD86 181 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 MAST3O60307 1309 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-907P-201ENST00000390924 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 INSIG1O15503 277 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 MMEP08473 750 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 GRIA2P42262 883 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 VPS72Q15906 364 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 HIPK4Q8NE63 616 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 ASB6Q9NWX5 421 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 KRT15P19012 456 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 CCKARP32238 428 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 GPR19Q15760 415 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 MIDNQ504T8 468 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 AWAT2Q6E213 333 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 IFNL3Q8IZI9 196 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 DCAF4Q8WV16 495 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 CPLX3Q8WVH0 158 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 ALG1Q9BT22 464 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 IER2Q9BTL4 223 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-907P-201ENST00000390924 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms