RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 A0A087X0T9 212 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 CXCL11O14625 94 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 FAM228BP0C875 321 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 CHMP4BP1P59074 171 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 DLG4P78352 724 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 MAF1Q9H063 256 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 SALL4Q9UJQ4 1053 aa25.92■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 CNMDO75829 334 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 PTK2Q05397 1052 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.91■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 MOCS3O95396 460 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 PPP2R5AQ15172 486 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 IQCEQ6IPM2 695 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 SRGAP2O75044 1071 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 TBX20Q9UMR3 447 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.9■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 DENND3A2RUS2 1198 aa25.89■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 ICAM3P32942 547 aa25.89■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 SMTNP53814 917 aa25.89■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 MYBPC2Q14324 1141 aa25.89■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 SLC18A3Q16572 532 aa25.89■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 GOLGA1Q92805 767 aa25.89■■□□□ 1.74
LHX3-201ENST00000371746 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PGK2P07205 417 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PPIL2Q13356 520 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 MOGSQ13724 837 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 TUBB2AQ13885 445 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 MTERF2Q49AM1 385 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 CEP112Q8N8E3 955 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.89■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 JAM2P57087 298 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 MYL7Q01449 175 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 KIFAP3Q92845 792 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 DGAT1O75907 488 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 KRT13P13646 458 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ATP4AP20648 1035 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ADSSP30520 456 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 Q3C1V9 767 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.88■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 EDNRBP24530 442 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 SAR1BQ9Y6B6 198 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PJA2O43164 708 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 XKR3Q5GH77 459 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 TRIM58Q8NG06 486 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PACSIN1Q9BY11 444 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ZNF302Q9NR11 478 aa25.87■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 BUB1O43683 1085 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 VAMP7P51809 220 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PPP3CAQ08209 521 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 SAAL1Q96ER3 474 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 EMSYQ7Z589 1322 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 TACC1O75410 805 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 WDR81Q562E7 1941 aa25.86■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 LRRN2O75325 713 aa25.85■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 GFPT2O94808 682 aa25.85■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 CNGA1P29973 690 aa25.85■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 GJA5P36382 358 aa25.85■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 GCLMP48507 274 aa25.85■■□□□ 1.73
LHX3-201ENST00000371746 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms