RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 KAT2BQ92831 832 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 HVCN1Q96D96 273 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 SCLT1Q96NL6 688 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ACCSQ96QU6 501 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CEP89Q96ST8 783 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 RNF208Q9H0X6 261 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM206Q9H813 350 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 SETD4Q9NVD3 440 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 AKT3Q9Y243 479 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 FSD2A1L4K1 749 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CCL5P13501 91 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ARL2P36404 184 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 NPTX2P47972 431 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CLCN3P51790 818 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC63Q05C16 580 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 IQCB1Q15051 598 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 FAM114A1Q8IWE2 563 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 LMBR1Q8WVP7 490 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 GLT1D1Q96MS3 346 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 HDAC6Q9UBN7 1215 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 DENND3A2RUS2 1198 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 TPM2P07951 284 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CYP2C9P11712 490 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 GLRA2P23416 452 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CASP5P51878 434 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ACLYP53396 1101 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CDC42EP1Q00587 391 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF20Q3BBV1 942 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 GLIS3Q8NEA6 775 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 BICD1Q96G01 975 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 NLRP4Q96MN2 994 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 SIP14410 1827 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 EVPLQ92817 2033 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 K7ERI5 159 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 M0QZ92 97 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 RPL13P26373 211 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PHKA2P46019 1235 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 EFNA5P52803 228 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GTF2BQ00403 316 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CAPSQ13938 189 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 BMT2Q1RMZ1 405 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 LHX8Q68G74 356 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CENPPQ6IPU0 288 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 RSPH3Q86UC2 560 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 RNF149Q8NC42 400 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GOLGA5Q8TBA6 731 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ASAP3Q8TDY4 903 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 BSNDQ8WZ55 320 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB118Q96PH6 123 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 FANCLQ9NW38 375 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NOD1Q9Y239 953 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PDXKO00764 312 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINC1P01008 464 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SPAG1Q07617 926 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 DRP2Q13474 957 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ITGA7Q13683 1181 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MTFR1Q15390 333 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 EDRF1Q3B7T1 1238 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 KSR1Q8IVT5 923 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms