RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 HDAC4P56524 1084 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PSMC5P62195 406 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP69A5D8W1 941 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KDM1AO60341 852 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KCNA4P22459 653 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RMDN3Q96TC7 470 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BARHL2Q9NY43 387 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RXRBP28702 533 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EFHC2Q5JST6 749 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LZICQ8WZA0 190 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FAF2Q96CS3 445 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NUP85Q9BW27 656 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MPP6Q9NZW5 540 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FAM170AA1A519 330 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TRAPPC3O43617 180 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MAN1A2O60476 641 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PTK2BQ14289 1009 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LIG3P49916 1009 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MED21Q13503 144 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CASP8Q14790 479 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NFU1Q9UMS0 254 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DENND3A2RUS2 1198 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP73A6NFT4 308 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SOX5P35711 763 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TMPRSS15P98073 1019 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 E2F5Q15329 346 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GDAP1Q8TB36 358 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ACAD9Q9H845 621 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ASB14A6NK59 587 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KRT4P19013 534 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CLCN6P51797 869 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ERFEQ4G0M1 354 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KCTD16Q68DU8 428 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF302Q9NR11 478 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PFDN1O60925 122 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MOCS3O95396 460 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RESTQ13127 1097 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TKFCQ3LXA3 575 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STX19Q8N4C7 294 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CXorf38Q8TB03 319 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DMTNQ08495 405 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SNX17Q15036 470 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MB21D1Q8N884 522 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TBX3O15119 743 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC22O60826 627 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BFARQ9NZS9 450 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 USP31Q70CQ4 1352 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 E9PMD0 336 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ACSL3O95573 720 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MMEP08473 750 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 HSD17B4P51659 736 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM270Q6UE05 265 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BTBD6Q96KE9 485 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.4□□□□□ -1.38
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