RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335790.7

LMO1-201, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,279 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-201ENST00000335790 PEX3P56589 373 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 KRT83P78385 493 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CCNA1P78396 465 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 KSR1Q8IVT5 923 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ASB14A6NK59 587 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 LRRC53A6NM62 1247 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PDHXO00330 501 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 FANCGO15287 622 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PON1P27169 355 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CCL15Q16663 113 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SPRYD7Q5W111 196 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 GBP6Q6ZN66 633 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 TBX20Q9UMR3 447 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SLC16A4O15374 487 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 P4HA2O15460 535 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 STRNO43815 780 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PGK2P07205 417 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 RFC5P40937 340 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 GRM1Q13255 1194 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 HGSNATQ68CP4 663 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 RRAGAQ7L523 313 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 BSNDQ8WZ55 320 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 FAM167AQ96KS9 214 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 FBXL18Q96ME1 805 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PORCNQ9H237 461 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SIX2Q9NPC8 291 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 DNAI1Q9UI46 699 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 USP20Q9Y2K6 914 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 EMSYQ7Z589 1322 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 TLR2O60603 784 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ARIH2O95376 493 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 GGPS1O95749 300 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SERPING1P05155 500 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CYP2C8P10632 490 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ARL2P36404 184 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 FMO5P49326 533 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 BFSP1Q12934 665 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 EMC2Q15006 297 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ZNF592Q92610 1267 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 GPR20Q99678 358 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 KIF5CO60282 957 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 EXOC3O60645 756 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PIGRP01833 764 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 UCHL3P15374 230 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SLC9A1P19634 815 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 GARTP22102 1010 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 ANXA13P27216 316 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 PRKCIP41743 596 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 SLC26A2P50443 739 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 CYP2J2P51589 502 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 STAT5BP51692 787 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO1-201ENST00000335790 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms