RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 JAKMIP2Q96AA8 810 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 LACRTQ9GZZ8 138 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 DEF6Q9H4E7 631 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 HAUS4Q9H6D7 363 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 RRAGCQ9HB90 399 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GCNT4Q9P109 453 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 FHOD1Q9Y613 1164 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD63C9JTQ0 380 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 PDHXO00330 501 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 FMO5P49326 533 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CCDC122Q5T0U0 273 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 C12orf56Q8IXR9 622 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SLC17A8Q8NDX2 589 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MCPH1Q8NEM0 835 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SPIRE2Q8WWL2 714 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 HSPBP1Q9NZL4 362 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 PNMA3Q9UL41 463 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 V9GYY5 206 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 DENND3A2RUS2 1198 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 AKR1B10O60218 316 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 TGFB3P10600 412 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 UCHL3P15374 230 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SPA17Q15506 151 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ZNF710Q8N1W2 664 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ERO1AQ96HE7 468 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 UNCXA6NJT0 531 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 BTBD19C9JJ37 291 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 LCA5LO95447 670 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SERPING1P05155 500 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CETPP11597 493 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ARID5AQ03989 594 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 BFSP1Q12934 665 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 EMC2Q15006 297 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 PPP2R5AQ15172 486 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CBWD6Q4V339 395 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CBWD3Q5JTY5 395 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CBWD5Q5RIA9 395 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GJB7Q6PEY0 223 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ZNF662Q6ZS27 426 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 TMEM174Q8WUU8 243 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MLXIPQ9HAP2 919 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 C17orf75Q9HAS0 396 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 AIPL1Q9NZN9 384 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 EXOC7Q9UPT5 735 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GTF2A2P52657 109 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 DLG4P78352 724 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CCL15Q16663 113 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 XXYLT1Q8NBI6 393 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SHCBP1Q8NEM2 672 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 BRI3BPQ8WY22 251 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 TMEM143Q96AN5 459 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MYO1AQ9UBC5 1043 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 DUSP10Q9Y6W6 482 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8IPA6NC78 632 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 KRT13P13646 458 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ADSSP30520 456 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 STAT5BP51692 787 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 VAV2P52735 878 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ASIC2Q16515 512 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 METTL7BQ6UX53 244 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MAP4K3Q8IVH8 894 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SEPT1Q8WYJ6 367 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 HVCN1Q96D96 273 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 CEP89Q96ST8 783 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MRFAP1Q9Y605 127 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 RTP1P59025 263 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHO2Q8TD55 490 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-201ENST00000331789 IFT74Q96LB3 600 aa19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms