RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 DENND3A2RUS2 1198 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD19C9JJ37 291 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CETPP11597 493 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 UCHL3P15374 230 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CCL15Q16663 113 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1328Q86T90 577 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35F6Q8N357 371 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 DEF6Q9H4E7 631 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SIX2Q9NPC8 291 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 FMO5P49326 533 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 BFSP1Q12934 665 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R5AQ15172 486 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CBWD6Q4V339 395 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 METTL7BQ6UX53 244 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2A2P52657 109 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 EMC2Q15006 297 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SPA17Q15506 151 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 AKR1B10O60218 316 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 DLG4P78352 724 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ARID5AQ03989 594 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SERPING1P05155 500 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ADSSP30520 456 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 STAT5BP51692 787 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 RTP1P59025 263 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GJB7Q6PEY0 223 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM143Q96AN5 459 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 HVCN1Q96D96 273 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 LCA5LO95447 670 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ERO1AQ96HE7 468 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CNGA1P29973 690 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 VAV2P52735 878 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP1BP68106 108 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SPAG5Q96R06 1193 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 CEP89Q96ST8 783 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.83■■□□□ 1.56
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.83■■□□□ 1.56
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